嵌合体RNA干扰（Chimera RNAi，简称嵌合RNAi) 利用小型干扰性 RNA/DNA 嵌合体促使 mRNA 毁灭。此技术由东京大学 Kaoru Saigo 教授和 Kumiko Ui-Tei 博士所发现，并且进行设计与应用开发。

与普通的 siRNA 相比，嵌合 RNAi 具备许多优点。首先，这种嵌合体已被证实能可靠的抑制10万个以上的人体基因。由于人体基因是一种精细复杂的基因网络，嵌合 RNAi 的独特设计成功的排除偏离目标的效应，包括micro RNA 所造成的影响。嵌合体 RNAi 技术的另一个优势，在于其在低浓度 (0.5~5nM) 情况下仍可有效发挥作用；只有 mRNA 受到破坏，而基因组并未受到任何影响。最后，由于 RNA/DNA 嵌合体同时具备有义链和反义链，它的化合物稳定性非常适合流水线体外/体内实验分析与应用，将干扰素诱生作用和其他不良反应降至最低。